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此次并非是广东第一次出现基孔肯雅热疫情，广东省卫健委网站信息显示，早在2010年10月，东莞就曾报告基孔肯雅热确诊病例。广东省卫健委2010年10月6日的一份通报显示，2010年10月1日至5日，东莞市新增15例基孔肯雅热确诊病例。截至10月5日16时，共报告基孔肯雅热病例204例（含回顾性调查病例），其中，经实验室确诊38例，疑似166例。目前所有病例均为轻症病例，病情稳定，无危重症及死亡病例。省卫生厅多次召开专题会议研究部署基孔肯雅热疫情防控工作，成立省卫生厅防控基孔肯雅热疫情领导小组，组建了广东省基孔肯雅热疫情防控专家组、医疗救治专家组。此外，还派出医疗救治专家组到东莞市指导基孔肯雅热医疗救治工作，并指导当地制定了《东莞市基孔肯雅热患者居家医学观察和住院治疗指引（试行）》。
相关论文显示，此后，茂名、广州、杭州等地的口岸均发现过输入性基孔肯雅热病例。而前述2010年发生在广东东莞的基孔肯雅热疫情则是我国首起基孔肯雅热社区暴发疫情。由东莞市疾病预防控制中心袁达康等人在“新发和再发传染病防治热点研讨会2011”提交的会议论文《我国首起基孔肯雅热社区暴发疫情的流行病学调查分析》显示，这起疫情共发现病例253例，其中确诊病例65 例，疑似病例188例，罹患率为 2.30％；首、末例病例发病时间分别为9月1 日和10月10日，9 月下旬病例数开始迅速增多，10月6日达到发病高峰；病例分布于13个村民小组中的9个，且最早出现并集中发布于其中两个村民小组，病例呈明显的家庭聚集性；病例的职业分布以家务及待业人员最多，共 133 例（占 52.57%），60 岁以上老年人发病数和罹患率最高，20~30 岁的青年人罹患率最低，不同年龄组村民的罹患率差异有统计学意义；实验室检测结果显示，疫情的毒株为中/东/南非流行株，与泰国2008、2009年同基因型毒株同源性达 99%。论文结论为：这是一起由输入性病例引起的本土社区基孔肯雅暴发疫情，输入源头未明。政府主导，多部门配合的联防联控工作机制是疫情防控行之有效的方法。
